Data Science Engineer
A rejoint le laboratoire BIMS de l'Institut Pasteur de Tunis en tant qu'ingénieur en science des données pour renforcer la surveillance épidémiologique et le traitement des données de santé.
- A conçu et déployé une application R Shiny de production dédiée à la surveillance en temps réel de la résistance aux antimicrobiens (AMR), combinant statistiques descriptives et inférentielles avec un filtrage dynamique par pathogène, classe d'antibiotique et région.
- A développé un pipeline ETL harmonisant 99 ensembles de données épidémiologiques hétérogènes en une base de données unifiée et prête à l'analyse grâce au fuzzy matching et à la normalisation, réduisant l'effort de prétraitement d'environ 65 %.
- A construit, calibré et validé des modèles compartimentaux SIR/SEIR et basés sur des agents pour simuler la dynamique des maladies infectieuses et quantifier l'impact des interventions.
- A mené des analyses de génétique des populations (fréquence alléliquée, association génotype-âge) ayant contribué à une publication évaluée par des pairs dans la revue Viruses (MDPI, IF > 4).
- A servi de pont analytique entre les cliniciens, les chercheurs de laboratoire et les acteurs de la santé publique, traduisant la recherche en insights directement exploitables pour la prise de décision.
Environnement technique