Stagiaire en Data Science – Traitement et Automatisation des Données RMN
Intégration de l'Institut de Chimie Moléculaire de Reims (CNRS UMR 7312) afin de développer un framework complet de traitement et d'automatisation pour des données RMN bidimensionnelles.
- Conception d'une pipeline de traitement des données RMN, depuis les fichiers Bruker (FID) jusqu'à la détection automatique des pics.
- Développement d'un générateur réaliste de spectres HSQC synthétiques avec génération automatique des annotations (ground truth) pour l'apprentissage supervisé.
- Conception, entraînement et optimisation d'un modèle de segmentation sémantique U-Net (U-NetPicker) pour le peak picking automatique dans les spectres RMN 2D.
- Développement et comparaison de plusieurs méthodes classiques de détection de caractéristiques (Harris, SUSAN, LoG, DoG, Hessian, Local Maxima et modèle électrostatique) avec des techniques de segmentation Watershed et DBSCAN.
- Évaluation des performances sur des données synthétiques et expérimentales (HMDB) à l'aide de métriques telles que Dice Score, Precision, Recall et F1-score.
- Réalisation d'une revue bibliographique sur l'intelligence artificielle appliquée à la RMN, les méthodes de peak picking et l'analyse automatisée des spectres multidimensionnels.
Environnement technique