Data Scientist, Plant Biologist & Computational Biologist

A piloté le développement d'un produit digital pour une application mobile dans le secteur de l'agriculture de précision.

• A conçu et implémenté un prototype de plateforme mobile.
• A analysé le statut des données et identifié les besoins en données pour le développement et la finalisation du projet.
• A déterminé les stratégies de transformation des données collectées sur le terrain pour intégration dans un dashboard.

A enseigné l'utilisation de SQL, Python et des algorithmes à des étudiants en sciences informatiques.

• A dispensé des cours sur SQL pour la gestion de bases de données.
• A formé les étudiants aux fondamentaux de Python.
• A transmis les concepts d'algorithmique.

A suivi un bootcamp en Data Science, complétant sa formation à travers des modules d'analyse de données et de développement de produits.

• A acquis des compétences approfondies en analyse de données.
• A développé des capacités de gestion de projet produit.
• A maîtrisé les principes de DevOps et machine learning.

A dirigé l'équipe R&D et data science, développant des solutions de machine learning avancées pour la prédiction et l'optimisation agricole.

• A développé un pipeline ML end-to-end pour la prédiction en épidémiologie environnementale utilisant Python et services cloud (Databricks).
• A architecturé et implémenté des bases de données SQL pour la gestion des données météorologiques.
• A mis en place des processus de monitoring automatisé des données pour assurer une haute disponibilité.
• A créé des solutions de visualisation pour l'interpolation géographique des données.
• A piloté l'infrastructure IoT pour la collecte de données multi-sources.

A mené le développement de systèmes de PCR haute débit pour l'expression génique au sein d'une équipe de recherche bioinformatique.

• A piloté la mise en place et l'optimisation de systèmes de PCR haute débit pour l'analyse d'expression génique.
• A implémenté des pipelines R/Bioconductor pour l'analyse des données de qRT-PCR.
• A conçu et validé des sondes spécifiques à chaque gène pour l'analyse ciblée.

A piloté l'optimisation et l'implémentation d'un système d'information pour la gestion des données de laboratoire au sein d'une unité de bioinformatique hospitalière.

• A implémenté et optimisé un LIMS (Laboratory Information Management System) pour la gestion centralisée des données de laboratoire.
• A formé et accompagné le personnel technique, les ingénieurs et les médecins à l'utilisation du système.
• A développé des workflows de traitement automatisé des données pour réduire les tâches manuelles.

A dirigé plusieurs projets de recherche en biologie végétale et bioinformatique, intégrant des technologies de pointe pour l'analyse de données biologiques complexes et la gestion d'une plateforme de phénotypage.

• A développé un pipeline d'analyse spatiale utilisant GIS et R pour une base de données de maladies.
• A piloté des projets d'intégration de données NGS et métabolomiques multi-sources.
• A implémenté des pipelines d'analyse du microbiome utilisant des outils spécialisés.
• A conçu l'infrastructure informatique d'une plateforme de phénotypage.
• A encadré et géré plusieurs doctorants et projets de recherche en biologie végétale.

A dirigé des projets de bioinformatique médicale, développant des pipelines d'analyse spécialisés pour les données virales et mises en place une infrastructure de traitement centralisée.

• A piloté des projets de bioinformatique médicale focalisés sur l'analyse de données de maladies virales.
• A développé des pipelines d'analyse personnalisés en utilisant plusieurs langages de programmation.
• A implémenté et maintenu une plateforme d'analyse de données bioinformatiques.

A mené des recherches fondamentales en photosynthèse végétale et bactérienne, développant des outils bioinformatiques pionniers et contribuant à la littérature scientifique internationale.

• A conduit des recherches en photosynthèse des plantes et des bactéries.
• A développé des outils bioinformatiques pour l'analyse de séquences biologiques.
• A publié les résultats de ses recherches dans des revues à comité de lecture.
• A présenté ses travaux lors de conférences internationales.